1、產業結構不合理
企業規模較小，產業集中度低，環境服務業比重偏低，全方位服務體系尚未建立、而一些企業的實踐似乎已經印證了這樣的觀點。據悉，原先只生產環境監測儀器的河北先河環保，已經將業務擴展至提供監測服務。“他們利用自己的產品和技術手段，為山東提供全省大氣、水質量監測和技術管理服務。”
2、政策機制不完善
優惠政策不配套，現有政策沒有執行到位;法律法規不健全，缺乏執行力;資金投入不足，企業融資難度大。在未來， 環境監測引入社會化服務也已經成為環境管理機制創新的重要內容，被環境保護主管部門提上重要議事日程，穩步加以推進。
3、技術創新能力不強
以企業為主體的環保技術創新體系不完善，產學研結合不夠緊密，技術開發投入不足，一些核心技術尚未完全掌握，部分關鍵設備依靠進口
4、市場不規范
地方保護、低價低質惡性競爭現象尤為嚴重，污染治理設施重建設、輕管理，設施運行效率和績效不高。市場化程度低，市場調控作用沒有充分發揮
